Il y a 20 ans, un petit garçon, dont les gênes ont été manipulés, est né. Les enfants aux gênes modifiés sont appelés Coordinateurs. Ce bébé, qui fut appelé Shōta par ses parents, fait partie de ces enfants. Les enfants nés "normalement" sont appelés Naturels. Il eut une vie plutôt paisible jusqu'à son entrée au lycée. A l'école primaire, les enfants Naturels et Coordinateurs s'entendaient parfaitement et se moquaient de leurs "origines". Mais au lycée, tout changea. Les jeunes élèves commençaient à comprendre la différence entre Naturels et Coordinateurs et les Naturels se mirent à devenir méchants envers les Coordinateurs. Même les professeurs n'aimaient pas les Coordinateurs et toléraient donc que les élèves insultent les Coordinateurs. Un jour, un des élèves insulta la mère de et là, il péta un plomb. Sa mère n'avait pas fait de lui un Coordinateur pour qu'il ait plus de chances à l'école, mais parce qu'elle voulait avoir un petit garçon aux cheveux bruns et aux yeux violets, juste ça. Après que Shōta eut cassé un bras et quelques doigts du Naturel, il se fit renvoyer immédiatement. Quelques jours plus tard, Shōta se mit déjà à chercher du boulot. Pendant qu'il était en ville, un groupe de Naturels extrêmistes attaquèrent sa famille et assassinèrent sa mère. Son père était au laboratoire en train de travailler donc il n'étais pas à la maison à ce moment-là. En revenant chez lui, découvrit le corps de sa mère criblé de balles et ses yeux encore ouverts...Il courut aux toilettes pour vomir puis après s'être un peu calmé, il ferma les yeux de sa mère et alla l'enterrer dans le jardin. Après cela, il alla prendre les économies que sa mère avait faites pour lui. Il mit ses affaires dans un grand sac à dos et une petite valise et quitta la maison. Avant de partir, il mit le feu à la maison. Lorsque ceci arriva, il n'avait que 16 ans. Il a changé son nom de famille pour celui de sa mère, Yamato. Puis il trouva du boulot en tant que serveur dans un petit café, loin de chez lui, dans une petite ville peu connue. Les seuls clients étaient ceux qui habitaient la ville donc après un certain temps, connaissait toute la ville. Il vivait avec le propriétaire qui était comme un père pour lui. Un jour, le propriétaire, Kazuo, lui parla d'un pensionnat spécial pour garçons. Il lui dit que le pensionnat était caché dans la forêt près de la ville et que, donc, s'il voulait aller y vivre, il pourrait quand même venir lui rendre visite quand il le voulait. dit qu'il voulait y réfléchir encore un peu et, le jour de ses 20 ans, il avoua à Kazuo qu'il allait partir pour le pensionnat. Ils invitèrent alors toute la ville pour fêter son anniversaire et pour lui dire au revoir. Il promit de revenir chaque année pour fêter son anniversaire avec eux et reçut pleins de cadeaux. Il avait complètement changé depuis qu'il était dans cette ville et il était heureux. C'est ainsi que le jour suivant il partit pour Suiheisen no jiyu.